研究方向为微生物学生化与分子生物学、化学生物学、合成生物学等，主要是以微生物活性天然产物分子为研究对象，综合微生物基因组学、分子生物学与生物化学、有机与分析化学、合成生物学和结构生物学等多领域的技术手段，用于基于组学技术的微生物源先导药物分子的发现；新颖化学骨架与结构单元的生物合成途径与酶催化机制解析；天然产物相关化学信号转导机制研究；合成生物学技术在药物创新与高产优产中的应用等。近年来多项研究成果发表在Nature Chemical Biology, PNAS等国际知名杂志上。